Samisk høgskoles forsknings- og utviklingsprosjekter utvikles i fag som eksempelvis språkvitenskap, duodji, reindrift, samfunnsfag, pedagogikk og journalistikk. Her en liste over de større prosjektene etter finansieringskilde: 

Norges forskningsråd

• Eatnama mánát skuvlema bálgáid alde: Nannet sámi mánáid identitehtta ja resilienssa skuvlenintitašuvnnaid tranformašuvnna bokte
• ReLing - Reshaping linguistic spheres in Sápmi: language policy, linguistic atmosphere, and namescapes in the multilingual North 
• Rievdan

Horizon

• Birgejupmi

Interreg

• Lohkanlihkku
• Indigenous Digital Storytelling

Sametinget

• Sámi mánáidgárdepedagogihkka ođđa áiggis dutkanprošeakta

Nordisk ministerråd og Kunnskapsdepartementet

• Sámi AI Lab
• Cultural impact of the first Sámi publishing company, Jårgaleaddji AS - The creation of sustainable indigenous music publishing practices
• Definihttavuohta, artihkkalat ja demonstratiivpronomenat davvisámegielas
• Sacred model of Sámi education
• Sámi áigerehkenastin
• Sámi etnomatematihkka
• Sámegiela didaktihka digitála oahppomateriála
• Sámi youth in transition
• Standardization of Minority Place Names - Norway

Her noen prosjekter som høyskolens fagmiljø driver forsknings- og utviklingsarbeid i, men som har annen hovedeier enn Samisk høgskole: 

• Arctic Silk Road
• CHARTER- Drivers and feedbacks of changes in Arctic terrestrial biodiversity (with Norwegian University of Life Sciences, NMBU)
• DistArctic
• Fuglan veit (med Universitetet i Tromsø - Norges arktiske universitet)
• GREENGROWTH (with Oslo University)
• Indigenous language resilience: from learners to speakers (with Oslo University)
• INN bygger kapasitet - Aktiv profesjonsutvikling i en virtuell verden (med Høgskolen i Innlandet)
• MAST Knowledge Sharing and Capacity Building Networks to Strengthen Indigenous Perspectives in Research
• Minecraft in Indigenous education (med Universitetet i Agder)
• Professional learning for educators: Nurturing indigenous pedagogies (with Memorial University of Newfoundland)
• Samiske stemmer i skolen
• Sámi and Indigenous aesthetics (with University of Wisconsin, Madison)
• Sámi mánná jurddavázzin - Sámi Children as Thought Herders: Storytelling and Critical Philosophical Inquiries in Indigenous Early Years Education (med Södertörns högskola)
• SápmiDem
• Textila arv

Prosjekt som er blitt avsluttet i de siste årene

• Arctic Indigenous Design Archives - AIDA-project - Arctic Indigenous Design Archives
• DigiÁrran
• Edvard Masoni - Ein samisk misjonær i kolonialismens tidsalder
• Epistemalaš modalitehta máná ehtalaš ja morálalaš árvvoštallamis
• Evaluering av fagfornyelsen i samiske skoler og for samiske elever i skoler for øvrig
• Kárášjoga skuvlla evalueren
• Lubmen- ja mannenpráksisat Mearrasámi guovlluin
• Movt boazosámi nuorat vásihit rasismma
• Rohttu mátkkis